c:\windows\system32\config\system が壊れているか見つかりません

業務で利用しているPCでWindowsUpdateを実施したところ、リブート時に上記メッセージが表示されて起動できなくなりましたorz。
セットアップCDを用いて起動後、chkdskを実施。その後c:\windows\repairディレクトリから上記ファイル他をコピー、再度セットアップCDを用いて修復セットアップを実施しました。面倒だ…。